医保门诊特殊病种报销起付线为300元。对未经门诊特殊病种报销资格认定和在非定点医疗机构治疗的，不予报销。具有两种或两种以上门诊特殊病种的，起付线不重复设置，封顶线合并计算（住院共用封顶者除外）。

不同的医保门诊特殊病种报销比例不同，封顶线也有所变化。一部分门诊特殊病种，实行门诊费用与住院费用报销共用封顶10万元，比如，报销比例为82%的重症尿毒症透析。另一部分门诊特殊病种只报销门诊费用，以参加城镇居民医保的重性精神病（含精神分裂症）患者为例，其门诊报销比例由50%提高至70%，封顶线由每年2000元提高至4000元。